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药物性质预测 · 环肽 ADMET
环肽 ADMET 性质预测报告
汇总 5 条环肽在 pepADMET、PeptiVerse、QikProp 等模型下的吸收、渗透性、毒性、血脑屏障与半衰期预测，并标注模型一致性和分歧。
靶点研究 · 环肽设计
MMP-2/MMP-9 环肽设计方向评估
从三条 MMP 环肽设计方向收敛到 FN-II 底物识别面与 proMMP-2–TIMP-2 激活界面两条可验证路线，梳理结构证据、先导序列和关键验证门槛。
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生成模型 · 环肽设计
CP-Composer 环肽序列—结构联合生成基线
在受体结合口袋条件下联合生成环肽序列与三维构象，并通过 OpenMM 建立头尾共价闭环；记录本机部署、单样本验证结果与适用边界。
分子动力学 · 环肽穿膜
Cyclic-peptide-X 膜内位置依赖扩散系数研究
论文方法链迁移至新环肽 Cyclic-peptide-X，完成吸附、偏置路径、7 个约束窗口、力自相关与 D(z) profile 计算，验证方法可执行性。
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分子动力学 · 多肽膜扩散
KTTKS 论文方法重建与膜内扩散系数报告
基于作者资产与角质层脂膜重建 KTTKS 计算链，覆盖 100 ns 吸附、7 个约束窗口、力自相关、D(z) 及一维扩散时间模型，并明确单案例验证边界。