结论速览
5 条环肽 ADMET 性质预测的核心发现
  • GCRFWCKH 毒性最高(pepADMET Tox 0.931),不建议继续开发。
  • AGPVY 最平衡:渗透性最好、口服吸收最高(36%)、毒性最低(0.185),最值得继续开发。
  • 5 条环肽口服吸收均差(pepADMET 全部 F-,QikProp 口服吸收 0~36%),不适合作为口服药物。
  • 二硫键环化肽(HCKGHCKG、GCRFWCKH)整体表现差:渗透性、口服吸收、BBB 均偏低,且 GCRFWCKH 毒性高。
LogD7.4 分配系数主:pepADMET对照:QikProp⚠ 部分一致
作用:LogD7.4 反映分子在生理 pH(7.4)下的脂水分配能力。数值越大越亲脂(易透膜但水溶性差),越小越亲水。是衡量口服吸收潜力的核心指标。
一致性:AGPVY、FFKYP 两模型判断一致;但含二硫键的 HCKGHCKG、GCRFWCKH 方向相反(QikProp 更保守)。
生物利用度 F主:pepADMET对照:QikProp✓ 一致
作用:口服生物利用度衡量药物经口服后进入体循环的比例。F+ 表示高生物利用度(≥20%),F- 表示低。肽类药物普遍面临口服吸收差的瓶颈。
一致性:两模型均判定 5 条环肽口服吸收低(pepADMET 全部 F-,QikProp 口服吸收 0~36%),结论一致。
BBB 血脑屏障穿透主:pepADMET对照:BBPpred✓ 一致
作用:血脑屏障穿透性决定药物能否进入中枢神经系统。BBB+ 表示可穿透。靶向脑部疾病需要高穿透,作用于外周靶点则应避免穿透。
一致性:两模型排序基本一致(FFKYP 最高、AGPVY 最低),且均判为可穿透(概率 > 0.6)。
膜渗透性主:pepADMET对照:PeptiVerse⚠ 部分一致
作用:膜渗透性衡量分子穿过生物膜的能力,单位 lg(cm/s)。按测定方法分三组:Caco-2(肠道吸收)、PAMPA(被动跨膜)、RRCK(细胞旁路)。数值越大渗透越强。
Caco-2 渗透性(pepADMET vs PeptiVerse 对比)
PAMPA 渗透性(pepADMET vs PeptiVerse 对比)
RRCK 渗透性(仅 pepADMET)
等级参考:> -5.0 高渗透;-5.0 ~ -6.0 中等;-6.0 ~ -7.0 低渗透;< -7.0 极低渗透(图中红线为 -6.0 阈值)。一致性:Caco-2 的 PeptiVerse 几乎无区分度,两模型绝对值有偏差但方向大致一致。
毒性主:pepADMET对照:PeptiVerse✗ 分歧
作用:毒性预测评估肽的潜在毒性风险(Tox 概率,>0.5 判为有毒),是药物安全性的首要考量。
⚠ 两模型分歧显著:PeptiVerse 与 pepADMET 的毒性判断几乎相反(仅 FFKYP 一致),本页以 pepADMET 为准,PeptiVerse 毒性仅供参考,不建议作为结论。图中红线为 0.5 毒性阈值。
毒性类型细分(6 类毒性概率,多标签可同时为高)
神经毒性细分(4 类神经毒概率)
HC50 半数溶血浓度(μM,数值越小越易溶血)
半衰期主:PeptiVerse对照:PlifePred2⚠ 部分一致
作用:半衰期衡量肽在体内的稳定性(抗降解能力),越长药效越持久、给药频率越低。pepADMET 网页端不支持环肽半衰期,故以 PeptiVerse 为主参照。
一致性:FFKYP、AGPVY 相对不稳定(两模型一致);GCRFWCKH 稳定性有分歧。PeptiVerse 值为内部回归值(越大越稳定);PlifePred2 为 log10(秒),短肽(<12 残基)属外推。
物理化学性质RDKit 计算
作用:分子量(MW)、脂水分配系数(LogP)、拓扑极性表面积(TPSA)由 RDKit 直接计算,是评估"类药性"(Lipinski 规则)的基础指标。
多肽性质总结表
每行一条环肽,总结其各项性质表现(★ 优 / △ 中 / ✗ 差)
注:渗透性等级按 pepADMET Caco-2 环肽值划分;毒性按 pepADMET Tox 概率(>0.5 有毒);半衰期按 PeptiVerse 值(越大越稳定);口服吸收按 QikProp 百分比。